SARS-CoV-2: Колко сериозен е вариантът B.1.1.529, сега наречен Omicron

Вариантът B.1.1.529 е докладван за първи път на СЗО от Южна Африка на 24^th ноември 2021 г. Първата известна потвърдена инфекция с B.1.1.529 е от проба, събрана на 9^th ноември 2021¹. Друг източник² показва, че този вариант е открит за първи път в проби, събрани на 11^th ноември 2021 г. в Ботсвана и на 14^th Ноември 2021 г. в Южна Африка. Оттогава броят на случаите на COVID-19 рязко се е увеличил в почти всички провинции в Южна Африка. Като на 27^th Ноември 2021 г., нови случаи на този вариант са съобщени и в Белгия, Хонконг, Израел, Обединеното кралство³, Германия, Италия и Чехия, които са свързани с пътуване по произход.  

Благодарим на южноафриканските власти, че не отделиха време за комуникация и споделяне на подходяща информация със световната научна общност, така че експертната група на СЗО да може да се срещне на 26^th Ноември 2021 г. и бързо да определите този вариант като Вариант, който предизвиква загриженост (VOC). Сериозността на въпроса може да се прецени от факта, че B.1.1.529 беше определен като вариант под наблюдение (VUM) само преди два дни на 24^th Ноември 2021 г., преди да бъде определен като ЛОС на 26^th Ноември 2021 г., без да бъде посочен първи като разследван вариант (VOI).  

Таблица: SARS-CoV-2 Варианти на загриженост (VOC) към 26 ноември 2021 г. 

Спешността при определянето на B.1.1.529 като вариант на опасения (VOC) беше оправдана, тъй като беше установено, че този вариант е най-разнообразният вариант на SARS-CoV-2 досега. В сравнение с вируса SARS-CoV-2, първоначално открит в Ухан, Китай, това има до 30 аминокиселинни промени, 3 малки делеции и 1 малка инсерция в шиповия протеин. От тези промени 15 са разположени в рецепторния свързващ домейн (RBD), частта от вируса, която му позволява да проникне в човешките клетки, което води до инфекция. Този вариант също има редица промени и изтривания в други геномни региони². Мутациите са толкова обширни, че може да се нарече нов щам, вместо вариант. Невероятно голямото количество шипове мутации означава повишена възможност за бягство от известни антитела, което прави този вариант въпрос на сериозно безпокойство⁵.  

Преминаването към нови варианти е обичайно за коронавирусите. В природата на нещата винаги е било коронавирусите да претърпяват мутация в геномите си с изключително високи темпове, поради липса на коректорна нуклеазна активност на техните полимерази; повече предаване, повече грешки в репликацията и следователно повече мутации се натрупват в генома, което води до нови варианти. Човешките коронавируси създават мутации, за да създадат нови варианти в най-новата история. Имаше няколко варианта, отговорни за епидемиите от 1966 г., когато беше записан първият епизод⁶. Но защо толкова обширна мутация в един взрив? Може, защото вариантът B.1.1.529 се е развил по време на хронична инфекция на имунокомпрометиран човек, вероятно нелекуван пациент с ХИВ/СПИН⁷.  

Каквато и да е причината за обширни мутации, ако бързата скорост, с която се е разпространила в Южна Африка, е индикация, еволюцията на този вариант може да има огромно влияние върху имунитета, трансмисивността и вирулентността и ефективността на съществуващите ваксини, които се използват в момента.  

Дали съществуващите ваксини ще останат ефективни срещу този нов вариант или ако ще има повече случаи на зарази с пробив на ваксини, в момента има малко данни, за да се направи някакво заключение. Въпреки това, в едно скорошно проучване, синтетичен вариант с 20 мутации в шиповия протеин показа почти пълно бягство от антитела⁷. Това показва, че новият вариант B.1.1.529 с много повече увеличени мутации може да покаже значително намалена неутрализация от антитела. Новият вариант обаче изглежда е по-предаваем поради бързата скорост, с която замени варианта Delta в Южна Африка, въпреки че настоящите данни не са достатъчно адекватни, за да се направи някаква надеждна оценка. По същия начин не е възможно да се коментира тежестта на симптомите на този етап.  

С оглед на факта, че Европа вече е затрупана от необичайно висок брой случаи на COVID 19 (поради силно предавания делта вариант) през последните няколко седмици и бързия темп, с който Омикрон (B.1.1.529) вариантът се разпространи в Южна Африка, замествайки наскоро делта варианта, няколко държави в Европа, включително Обединеното кралство, Германия и Италия, наложиха ограничения за пътуване на пристигащи от Южна Африка и от съседни страни като Ботсвана, Малави, Мозамбик, Замбия и Ангола. Страхувайки се от най-лошото, Израел ще забрани влизането на посетители от всички страни.  

Светът инвестира толкова много в разработването и прилагането на ваксини срещу COVID-19, за да предпази хората от пандемията. Въпросът, който е най-важният в съзнанието на учените и властите, е дали основните ваксини срещу COVID-19 като Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson ще останат ефективни и срещу вариант Omicron (B.1.1.529) . Това се подхранва от факта, че в Южна Африка са докладвани пробивни инфекции. Двата случая в Хонконг също са получили дози ваксина⁹. 

Разработване на "панкоронавирусни" ваксини¹⁰ (платформи за мултивалентни ваксини¹¹) изглежда е необходимостта на часа. Но по-бързо може да е възможно бързо да се произвеждат бустерни дози от иРНК и ДНК ваксини, покриващи мутациите. В допълнение, наскоро одобрените антивирусни (Merck's Molnupiravir и Pfizer's Paxlovid) трябва да са полезни при защитата на хората от хоспитализация и смърт.   

 *** 

Литература:  

1. СЗО 2021. Новини – Класификация на Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Публикувано на 26 ноември 2021 г. Предлага се онлайн на адрес https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Европейски център за превенция и контрол на заболяванията. Последици от появата и разпространението на SARSCoV-2 B.1.1. 529 вариант на загриженост (Omicron), за ЕС/ЕИП. 26 ноември 2021 г. ECDC: Стокхолм; 2021 г. Предлага се онлайн на адрес https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Press release – First UK cases of Omicron variant identified. Published 27 November 2021. Available at https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. СЗО, 2021. Проследяване на варианти на SARS-CoV-2. Предлага се онлайн на https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: потомък от B.1.1, свързан с Южна Африка с голям брой мутации на Спайк #343. Предлага се онлайн на https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Прасад U.2021. Варианти на коронавирус: какво знаем досега. Научен европеец. Публикувано на 12 юли 2021 г. Предлага се онлайн на адрес http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Работа с ваксините – Какво знаем за новия вариант на коронавирус B.1.1.529 и трябва ли да се притесняваме? Наличен в https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Висока генетична бариера за избягване на поликлонално неутрализиращо антитяло на SARS-CoV-2. Природа (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Силно мутиралият вариант на коронавирус поставя учените нащрек. природата News. Актуализирано на 27 ноември 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Сони Р. 2021. „Пан-коронавирусни“ ваксини: РНК полимераза се появява като цел за ваксина. Научен европеец. Публикувано на 16 ноември 2021 г. Достъпно на http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Съобщение за новини – NIAID издава нови награди за финансиране на „пан-коронавирусни“ ваксини. Публикувано на 28 септември 2021 г. Налично на https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***