Kākāpō Parrot: Геномното секвениране е от полза за програмата за опазване

Папагал Kākāpō (известен също като „бухал папагал” поради неговите подобни на бухал черти на лицето) е критично застрашен вид папагал, роден в Нова Зеландия. Това е необичайно животно, защото е най-дълго живялата птица в света (може да живее до 90 години). С тегло около 3-4 кг, той е и най-тежкият, единствен нелетящ и нощен папагал в свят.  

Kākāpō обитават Нова Зеландия от еволюцията им през изолация но техните население намаля бързо. През 1970-те години на миналия век е известно, че съществуват само 18 мъжки kākāpō. Съществуването на женски папагали Kākāpō беше потвърдено през 1980 г. Благодарение на интензивното управление на опазването, папагалите Kākāpō бяха изведени от ръба на изчезването. Техният брой е бил 51 през 1995 г. Днес 247 kākāpō са живи^1,2.  

За да подпомогне опазването, проектът Kākāpō125+ възникна през 2015 г. за секвениране на геномите на 125 живи какапо плюс някои важни наскоро починали индивиди. Идеята беше да се подобри генетичното управление на kākāpō, особено за справяне с ниската репродуктивна продукция (безплодие) и болестта, която възпрепятстваше възстановяването. Пълното сглобяване на ниво хромозома на референтния геном на индивидуално какапо беше завършено през 2018 г.³.  

В проучване, публикувано на 29^th През август 2023 г. изследователският екип докладва за секвениране на геномите на почти цялата популация на какапо (към 2018 г.) от 169 какапо, от 125 живи индивида и 44 съхранени проби. Данните на нивото на популацията свързват генетичното разнообразие между видовете със специфични ДНК последователности, свързани с черти като чувствителност към болести, растеж на пилета и т.н. Това може да помогне за идентифициране на рисковете за здравето по-рано, за да се планира лечение, персонализирано за отделната птица kākāpō. Този подход за идентифициране на специфични генетични характеристики, които са от решаващо значение за оцеляването, може да бъде преназначен за управление на опазването на други застрашените вид^4,5.  

*** 

Литература:  

1. Отдел за опазване. Правителството на Нова Зеландия. Възстановяване на Kākāpō. Наличен в  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Природо-научен музей. Странните какапо в Нова Зеландия са изтеглени от ръба на изчезване. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Отдел за опазване. Правителството на Нова Зеландия. Kākāpō125+ генно секвениране https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. Университет на Отаго 2023 г. Новини – Спасяване на видове от изчезване – висококачественото секвениране на популациите на kākāpō осигурява пробив в разбирането на ключова консервационна генетика. Наличен в https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Достъп на 29 август 2023 г.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. Геномиката на kākāpō за целия вид предоставя инструменти за ускоряване на възстановяването. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Предпечат в bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***