The assay time is considerably reduced from about an hour to few minutes by the newly reported RTF-EXPAR method which uses reverse transcriptase-free (RTF) approach for conversion of РНК в ДНК followed by EXPAR (Exponential Amplification Reaction) for amplification at single temperature.
Controlling the rate of Covid-19 spread requires an accurate and a faster virus testing strategy. RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction), the most accurate testing method being currently employed is a two-step test that takes around 60 minutes per sample.
Изследователите от университета в Бирмингам съобщиха за нов метод за откриване на SARS-CoV-2. Това може да позволи много по-бързо тестване и е достатъчно чувствително.
Откриването на вирусна РНК чрез RT-PCR (верижна реакция с обратна транскриптаза) включва превръщане на вирусна РНК в комплементарна ДНК (кДНК), последвано от амплификация на сДНК чрез количествен PCR (qPCR). След това сДНК се открива с помощта на флуоресцентно багрило. Това отнема до един час.
The assay time is considerably reduced from about an hour to few minutes by the newly reported RTF-EXPAR method which uses reverse transcriptase-free (RTF) approach for conversion of RNA into ДНК followed by EXPAR (Exponential Amplification Reaction) for amplification at single temperature. The amplification taking place at a single temperature is the key to speed, because it avoids lengthy heating and cooling steps of RT-PCR. Further, the section of DNA being amplified is smaller compared RT-PCR. Hence, EXPAR generates up to 108 strands of DNA product in few minutes. The duplex formation is monitored, as in RT-PCR method using fluorescent dye, SYBR Green.
Интересното е, че новият метод може да бъде модифициран за откриване на няколко други инфекциозни заболявания, причинени от РНК вируси, например Ебола, RSV и др.
Източник (и):
Картър и др. (2020). Под 5-минутно откриване на SARS-CoV-2 РНК с помощта на реакция на експоненциална амплификация без обратна транскриптаза, RTF-EXPAR. Предпечат. Публикувано в medRxiv Публикувано на 04 януари 2021 г. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
