Проект за човешки протеом (HPP): План, покриващ 90.4% от освободения човешки протеом

Човешки Proteome Project (HPP) was launched in 2010 after successful completion of Човешки Genome Project (HGP) to identify, characterise and map човешки proteome (the entire set of proteins expressed by the човешки genome). On its tenth anniversary, HPP has released the first high-stringency blueprint that covers 90.4% of the човешки proteome. As the code of life, this milestone has very significant implications for човешки health and therapeutics.   

Завършен в 2003, Човешки Genome Project (HGP) was an international collaboration set up in 1990 with an aim to identify the complete set of човешки genes and to determine the complete sequence of DNA bases in the човешки genome. On January 15, 2001, HGP had released initial sequence and analysis of the човешки genome. Identifying, characterizing and mapping of човешки proteome (entire complement of proteins coded by the genome) was the next logical step. Therefore, Човешки Proteome Organization (HUPO) was formed on February 9, 2001 to promote proteomics research. On September 23, 2010 HUPO officially launched Човешки Proteome Project (HPP) with an aim to prepare a blueprint of the човешки протеом ⁽¹⁾.  

Анализът на човешки геном predicts around 20,300 protein-coding genes. The entire set of proteins coded by these genes constitute the ‘човешки proteome’. Човешки proteome is much larger than ‘human genome’ because one gene can be expressed in range of forms (proteoforms) as a result of chemical modifications during and after translation. It is estimated that a million proteoforms may coexist in a single individual. In 2010, at the start of HPP, barely 70% of the proteins predicted by the genome analysis were identified. The agenda of the proteome project was to fill this knowledge gap. With the advances in technology, it has become possible to detect and quantify proteins and their forms with higher precision. Still, there are a good number of missing proteins (протеини предсказано от анализа на генома, но все още неоткрито) ^(2,3). Проектът все още е в ход; обаче е постигнат крайъгълен камък. 

На 16 октомври 2020 г. на десетата си годишнина HPP пусна първия проект с висока строгост, който покрива 90.4% от човешкия протеом ⁽¹⁾. Това значително подобрява познанията ни за човешката биология и разбирането на молекулярните механизми на клетъчно и молекулярно ниво, особено ролята, която играе човешкият протеом, който директно води до извършване на изследвания и развитие на диагностика и терапия за рак, сърдечно-съдови и инфекциозни заболявания, особено за персонализирани и прецизна медицина ⁽⁴⁾. 

Развитието на човека Протеин Atlas представя много значителен напредък за по-нататъшни изследвания в областта на човешката диагностика и терапия ^(5,6).  

***

Литература:

1. HUPO 2021. Хронология на протеомиката. Предлага се на https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Протеомът на човека. Предлага се онлайн на https://www.nextprot.org/about/human-proteome Посетен на 30 декември 2020 г. 

3. Inserm, 2020. Протеомика: кодът на живота, преведен с повече от 90%. Публикувано на 07 декември 2020 г. Предлага се онлайн на адрес https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Посетен на 30 декември 2020 г.  

4. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Високострог план на човешкия протеом. Публикувано: 16 октомври 2020 г. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A., and Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Пространствена локализация на човешкия протеом в здравето и болестта. Protein Science, том 30, брой 1. Първо публикувано: 04 ноември 2020 г. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. Атласът на човешките протеини 2020. Атлас на човешките протеини Наличен онлайн на адрес https://www.proteinatlas.org/about Посетен на 30 декември 2020 г. 

***