Проект за човешки протеом (HPP): План, покриващ 90.4% от освободения човешки протеом

Човешки Проектът Proteome (HPP) стартира през 2010 г. след успешно завършване на Човешки Геномен проект (HGP) за идентифициране, характеризиране и картографиране човешки протеом (целия набор от протеини, експресирани от човешки геном). На своята десета годишнина HPP пусна първия план с висока строгост, който обхваща 90.4% от човешки протеом. Като код на живота, този крайъгълен камък има много важни последици за човешки здраве и терапия.   

Завършен в 2003, Човешки Genome Project (HGP) е международно сътрудничество, създадено през 1990 г. с цел идентифициране на пълния набор от човешки гени и за определяне на пълната последователност на ДНК базите в човешки геном. На 15 януари 2001 г. HGP публикува първоначална последователност и анализ на човешки геном. Идентифициране, характеризиране и картографиране на човешки протеом (цялата съвкупност от протеини, кодирани от генома) беше следващата логична стъпка. Следователно, Човешки Proteome Organisation (HUPO) е създадена на 9 февруари 2001 г. за насърчаване на изследванията в областта на протеомиката. На 23 септември 2010 г. HUPO стартира официално Човешки Проект Proteome (HPP) с цел изготвяне на план на човешки протеом ⁽¹⁾.  

Анализът на човешки геном прогнозира около 20,300 XNUMX гени, кодиращи протеини. Целият набор от протеини, кодирани от тези гени, представляватчовешки протеом". Човешки протеомът е много по-голям от „човешкия геном“, тъй като един ген може да бъде експресиран в набор от форми (протеоформи) в резултат на химични модификации по време и след транслацията. Изчислено е, че един милион протеоформи могат да съществуват едновременно в един индивид. През 2010 г., в началото на HPP, бяха идентифицирани едва 70% от протеините, предвидени от анализа на генома. Дневният ред на проекта за протеоми беше да запълни тази празнина в знанията. С напредъка на технологиите стана възможно откриването и количественото определяне на протеините и техните форми с по-висока точност. Все пак има голям брой липсващи протеини (протеини предсказано от анализа на генома, но все още неоткрито) ^(2,3). Проектът все още е в ход; обаче е постигнат крайъгълен камък. 

На 16 октомври 2020 г. на десетата си годишнина HPP пусна първия проект с висока строгост, който покрива 90.4% от човешкия протеом ⁽¹⁾. Това значително подобрява познанията ни за човешката биология и разбирането на молекулярните механизми на клетъчно и молекулярно ниво, особено ролята, която играе човешкият протеом, който директно води до извършване на изследвания и развитие на диагностика и терапия за рак, сърдечно-съдови и инфекциозни заболявания, особено за персонализирани и прецизна медицина ⁽⁴⁾. 

Развитието на човека Протеин Atlas представя много значителен напредък за по-нататъшни изследвания в областта на човешката диагностика и терапия ^(5,6).  

***

Литература:

1. HUPO 2021. Хронология на протеомиката. Предлага се на https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Протеомът на човека. Предлага се онлайн на https://www.nextprot.org/about/human-proteome Посетен на 30 декември 2020 г. 

3. Inserm, 2020. Протеомика: кодът на живота, преведен с повече от 90%. Публикувано на 07 декември 2020 г. Предлага се онлайн на адрес https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Посетен на 30 декември 2020 г.  

4. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Високострог план на човешкия протеом. Публикувано: 16 октомври 2020 г. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A., and Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Пространствена локализация на човешкия протеом в здравето и болестта. Protein Science, том 30, брой 1. Първо публикувано: 04 ноември 2020 г. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. Атласът на човешките протеини 2020. Атлас на човешките протеини Наличен онлайн на адрес https://www.proteinatlas.org/about Посетен на 30 декември 2020 г. 

***